Hace 2 dias ajecuté un .exe que estaba infectado por un troyano (no es mio, y ha sido accidentalmente), me aparecieron mensajes de error de que faltaban archivos dll y demas. No le tomé mayor importancia y me confié en que no se habia ejecutado porque supuse que aunque fuera un troyano, al faltarle librerias no se ejecutaria. Al cabo de varias horas, cuando volvi a mi casa, me encuentro con actividades sospechosas en mi cuenta de paypal, que he conseguido solucionar perfectamente, asi que deduje que estaba infectado (un poco raro porque despues de ejecutarlo no accedi a mi cuenta de paypal ni introduje fisicamente la contraseña en el teclado...). Cambie las contraseñas ( en otro pc ) y me dispuse a quitarme el "bicho" de encima. Le pase el Superantyspyware, el AVG antivirus (que sustitui temporalmente por el que tenia, NOD32),el CCleaner, el Malwarebytes y el Spybot - Search & Destroy. Algunos pillaban unas cosas, otros otras... pero no se si pillaban lo que tenia que pillar, y me dio la impresión de que no. Lo raro de todo esto es que, he mirado los programas que se inician con Windows desde "msconfig" pero no me aparece ninguno sospechoso y tampoco tengo ningun proceso activo que parezca sospechoso (podria subir una foto para que lo viera aun asi). El problema viene ahora y es que de vez en cuando, estando tan normal con una ventana abierta, se pone en "background" y el icono de de la barra del sistema de la suite de la grafica aparece. Voy a intentar explicarme:

Imaginemos que tenemos una ventana abierta, una carpeta o algun programa por ejemplo. Imaginemos que no la tenemos maximizada y estamos viendo el escritorio detras... Pues lo que me ocurre es lo mismo que si tu en ese caso pincharas en el escritorio teniendo la ventana al frente. La pantalla pasa a background para tomar el control del escritorio pero sin llegar a minimizarse. Y por otra parte, el icono de al lado del reloj de la suite de AMD de la grafica pasa a desvelarse (no se abre pantalla ni nada, solo aparece el icono), cuando lo normal es que este oculta y se viera dandole a la flechita para ver los programas ocultos. Esto me preocupa porque es como si algun programa estuviera ejecutandose de fondo e intentara ejecutarse o de alguna forma coger algun dato del explorador de ventanas de Windows.

No tengo la opción de usar restaurar sistema, porque no tengo puntos. No puedo formatear porque tengo demasiados datos valiosos y el Windows demasiado "trabajado" como para empezar de 0. Es un tema concreto y raro, pero necesito ayuda!

PD: tengo el ejecutable del troyano aun por si con el se pudiera sacar algo.

Adjunto imagen de procesos. Los que aparecen en verde es que los reconozco como programas que he instalado yo, los demas o son del sistema o no los reconozco.