Sobre recuperar el sistema, sin verlo, no sé en qué parte de la instalación/actualización se quedó exactamente y qué es lo que hizo, así que no te puedo decir una fórmula mágica para recuperarlo.

Lo que sí puedes recuperar esos documentos.

• Arrancas con un LiveCD, de Ubuntu o el que sea.
• Con el explorador de archivos, seguramente tengas esas particiones montadas, metes un stick USB y el copiar/pegar de toda la vida.
• Si no tuvieras el disco duro montado, puedes usar una utilidad gráfica que se llama Utilidad de discos (original nombre xD). En Ubuntu no sé, pero en Debian está en Aplicaciones/Herramientas del sistema/Utlidad de discos. Desde ahí puedes "montar" las unidades de tu disco duro, que es algo así como hacerlas accesibles a través de un directorio (estilo /media/disco1 ó /mnt/disk1, etc.)

Puedes usar un LiveCD para pasar archivos entre Ubuntu y Windows, y luego formatear la de Ubuntu

Sobre arreglarlo, pues no te puedo decir nada porque yo se lo justito de Linux para manejarme un poco, pero seguro que si gorris se pasa por aqui te lo soluciona en un momento

Salu2